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Sistema EES en puertos europeos: implementación, plazos y controles biométricos 2026

La Unión Europea da un paso más en proteger sus fronteras con un nuevo sistema de entrada y salida que, en estos momentos, se está implementando de forma gradual hasta su obligatoriedad durante este 2026.

Publicado el 13.01.2026
El Sistema de Entrada/Salida (EES) implica, además del control de pasaporte, un control biométrico facial y de las huellas dactilares de los viajeros (FP).

¿Qué es el Sistema de Entrada/Salida (EES)?

El Sistema de Entrada/Salida (EES) es el nuevo registro de personas con pasaportes de países no miembros de la Unión Europea que realizan estancias de corta duración, 90 días, en uno de los 29 países que utilizan el sistema.

Además del control de pasaporte, se realiza un control biométrico facial y de las huellas dactilares de los viajeros para determinar que la persona es quien dice ser en su documento oficial.

En vigor desde el 12 de octubre de 2025, el EES se acabará de implementar a lo largo de los próximos seis meses y coexistirá con los controles fronterizos tradicionales. El objetivo es reemplazar el sellado manual por completo, a más tardar, el 10 de abril de 2026.

  • “La puesta en marcha es progresiva porque los distintos puertos, aeropuertos, estaciones ferroviarias van a ritmos distintos y porque existen distintos puntos fronterizos interiores y con terceros países que ha requerido de un acuerdo conjunto entre todos los miembros de la UE”, valora para PierNext Bernat Baró, director de Seguridad Corporativa del Port de Barcelona

El EES proporciona a las autoridades nacionales información en tiempo real sobre quién entra en la UE y cuándo, lo que supone un paso importante en la modernización y el refuerzo de la seguridad de las fronteras de la UE. Una vez que esté plenamente operativo, el sistema también detectará a las personas que se quedan más tiempo del permitido y los casos de fraude de documentos e identidad, lo que garantizará una experiencia de viaje más segura para todos.

En los próximos meses, la Comisión Europea y eu-LISA (Agencia de la Unión Europea para la Gestión Operativa de Sistemas Informáticos a Gran Escala)  apoyarán a los Estados miembros para garantizar el buen funcionamiento del sistema.

El sistema EES ofrece información en tiempo real de quién entra en la UE y cuándo (UE).

¿Por qué se implementa el EES?

La historia del EES se remonta a casi una década. La Comisión Europea presentó la primera propuesta el 6 de abril de 2016 como parte del paquete ‘Fronteras inteligentes’. Tras las negociaciones con el Parlamento Europeo y el Consejo, se llegó a un acuerdo en julio de 2017. 

El Reglamento EES, junto con una modificación específica del Código de fronteras Schengen, se adoptó el 20 de noviembre de 2017 y entró en vigor el 29 de diciembre de 2017.

Fue el 4 de diciembre de 2024, cuando la Comisión propuso introducir una puesta en marcha progresiva del sistema. “Las políticas de seguridad han cobrado un mayor protagonismo en esta legislatura, como se ve por ejemplo en la inversión para mejorar la movilidad militar”, apunta Baró.

La meta es, en este caso, establecer una política común de las entradas y salidas del espacio europeo, ya que controlar el movimiento de personas entre países de la Unión es complejo sin una visión global y compartida.

El objetivo del EES es establecer una política común de las entradas y salidas del espacio europeo, ya que controlar el movimiento de personas entre países de la Unión es complejo sin una visión global y compartida.

¿A quién se aplica el EES?

El Sistema de Entrada/Salida se aplica a ciudadanos de terceros países (no pertenecientes a la UE, Islandia, Liechtenstein, Noruega o Suiza) que realizan estancias de corta duración de hasta 90 días en un período de 180 días, ya sea que necesiten o no un visado Schengen de corta duración.

  • El EES no se aplica a: ciudadanos de la UE, Islandia, Liechtenstein, Noruega o Suiza; titulares de permisos de residencia de larga duración en países del espacio Schengen; trabajadores fronterizos; y titulares de visados de larga duración o permisos de residencia emitidos por países del espacio Schengen. Los beneficiarios del Acuerdo de Retirada del Brexit también están exentos.

El EES no se aplica a ciudadanos de la UE (FP).

Beneficios del nuevo método de control en fronteras

  • Modernizar e incrementar  la eficiencia de los controles fronterizos
    La sustitución del sellado de los pasaportes agiliza los controles fronterizos y permite que el personal trabaje de manera más eficiente.
  • Facilitar y agilizar el cruce de fronteras
    Con el EES, los viajeros pasarán menos tiempo realizando trámites fronterizos gracias a unos controles más rápidos, las opciones de autoservicio y la posibilidad de facilitar la información por adelantado.
  • Prevenir la migración irregular
    Al utilizar datos dactiloscópicos y faciales, se impide que las personas sobrepasen su estancia o utilicen identidades falsas.
  • Aumentar la seguridad en el espacio Schengen
    El EES permitirá a los agentes de fronteras y a las autoridades policiales acceder a información importante sobre los viajeros, ayudándolos a detectar riesgos para la seguridad y a apoyar la lucha contra los delitos graves, la criminalidad organizada y el terrorismo.

“Lo primero que tienen que hacer los ciudadanos de terceros países es registrarse, algo que deberán hacer cada tres años. Pero si se trata de alguien que entra y sale asiduamente para visitar a sus familiares, por ejemplo, con un primer registro ya tendrán suficiente”, señala el director de Seguridad Corporativa del Port de Barcelona.

Los datos que registra la EES se almacenan durante tres años (FP).

¿Qué datos almacena el sistema?

El EES registra electrónicamente los siguientes datos de cada viajero:

  •     Datos personales: nombre completo, fecha de nacimiento, nacionalidad, género, datos del documento de viaje.
  •     Datos biométricos: huellas dactilares e imagen facial digitalizada.
  •     Información de viaje: fecha, hora y lugar de cada entrada y salida.
  •     Información sobre denegaciones de entrada, si procede.

Los datos se almacenan durante tres años desde la última entrada o salida registrada, cumpliendo con el Reglamento General de Protección de Datos (RGPD) de la UE.

Los datos se almacenan durante tres años desde la última entrada o salida registrada, cumpliendo con el Reglamento General de Protección de Datos (RGPD) de la UE.

Protección de datos: la importancia del cumplimiento normativo

La implementación de sistemas biométricos como el EES requiere un cumplimiento estricto del Reglamento General de Protección de Datos (RGPD) de la Unión Europea, especialmente cuando se trata de datos biométricos considerados de "categoría especial" por su sensibilidad.

El artículo 35 del RGPD establece que cualquier tratamiento de datos de alto riesgo debe incluir una Evaluación de Impacto en la Protección de Datos (EIPD) previa que justifique la necesidad, idoneidad y proporcionalidad del sistema. Esta evaluación debe considerar si existen alternativas menos intrusivas que puedan lograr los mismos objetivos de seguridad y eficiencia.

El caso AENA: lecciones sobre implementación biométrica

Un ejemplo reciente ilustra la importancia del cumplimiento normativo en sistemas biométricos. En noviembre de 2024, la Agencia Española de Protección de Datos (AEPD) impuso a AENA una sanción de 10,04 millones de euros por implementar sistemas de reconocimiento facial en ocho aeropuertos españoles sin realizar una EIPD válida.

La resolución de la AEPD señaló que AENA utilizó un sistema de identificación "uno a varios" (1:N) con almacenamiento centralizado de patrones faciales de más de 62.000 pasajeros, cuando existían alternativas menos intrusivas. El organismo determinó que el tratamiento violaba el principio de minimización de datos, ya que almacenaba muchos más datos personales que los métodos tradicionales de comprobación visual.

Este caso subraya tres principios fundamentales para cualquier implementación biométrica:

  •   Necesidad y proporcionalidad: el sistema debe ser estrictamente necesario y no existir alternativas menos invasivas.
  •   Minimización de datos: solo deben recogerse los datos estrictamente necesarios para el fin específico.
  •     Evaluación previa: una EIPD completa debe realizarse antes del despliegue, no después.

A diferencia del caso AENA, el Sistema de Entrada/Salida europeo ha sido diseñado desde su origen cumpliendo estrictamente el RGPD, con evaluaciones de impacto realizadas a nivel europeo, arquitectura técnica validada por eu-LISA, y supervisión continua del Supervisor Europeo de Protección de Datos. El sistema fue aprobado mediante Reglamento (UE) 2017/2226 tras años de análisis y consultas, garantizando que cada elemento responde a una necesidad de seguridad fronteriza legítima y proporcionada.

Esta diferencia metodológica explica por qué el EES puede operar a escala europea con plenas garantías jurídicas, mientras que implementaciones ad hoc sin el marco regulatorio adecuado pueden enfrentar sanciones significativas. La lección es clara: en materia de biometría fronteriza, el cumplimiento normativo no es opcional, es fundamental.

Despliegue del EES en el Port de Barcelona

A nivel estatal, este trámite es competencia del Cuerpo Nacional de Policía. La Secretaría de Estado de Seguridad, Puertos del Estado y las Autoridades Portuarias han establecido un marco de trabajo para su implantación a través de un convenio de colaboración.

En el caso del Port de Barcelona, se acaba de licitar el servicio que tiene como objetivo la adquisición e instalación del equipamiento automatizado necesario para el control fronterizo. 

El sistema EES debe recoger los datos biométricos (huella dactilares y faciales), y los datos personales: nombre, pasaporte, fecha y lugar de entrada/salida de la UE.

El coste de la implantación, cofinanciado por Fondos Europeos para la Seguridad Interior de la UE, se ha valorado en unos 12 millones de euros, e incluye la siguiente infraestructura, repartida en las terminales de cruceros Terminal C (pública), Terminal E (Carnival), Terminal G (Royal Caribbean) y Terminal H (MSC) y las terminales de ferris Contradique y Transmediterránea:

  • 33  Puertas ABC
  • 13 Tabletas de registro
  • 43 Tabletas de verificación
  • 7 Contenedores
  • 134 Kioskos

Baró explica que su implementación en el ámbito portuario puede ser más complejo que en el aéreo, especialmente hasta que este proceso se convierta en parte de la rutina operativa. El motivo, en el caso de Barcelona, es la diversidad del modelo, que maneja un importante volumen de pasajeros entre ferris y cruceros. En 2024, los pasajeros se acercaron a los 5,4 millones de personas, de los cuales 1,74 millones corresponden a pasajeros de ferri.

  • “La complejidad reside en que estos flujos de personas no transitan por única terminal, por eso la propia arquitectura del puerto complica la operativa. Además, los controles de los pasajeros que viajan en su vehículo van a ralentizar mucho las operativas de embarque y desembarque, ya que se deberán instalar los sistemas del EES en equipos móviles dentro de contenedores ubicados a pie de muelle”, detalla Baró. 

Aplicación móvil Travel to Europe

Para facilitar el proceso fronterizo, Frontex ha desarrollado la aplicación móvil Travel to Europe, que permite pre-registrar información hasta 72 horas antes de llegar o salir de un país europeo que utilice el EES. La aplicación escanea el pasaporte biométrico mediante NFC, captura una imagen facial y permite responder al cuestionario de entrada por adelantado.

Aunque el uso de la app es voluntario, se espera que reduzca significativamente los tiempos de espera en fronteras. Actualmente está disponible en Suecia, con expansión prevista a Francia, Países Bajos e Italia durante 2026. Es importante destacar que no sustituye los controles fronterizos ni garantiza la entrada automática.

Aplicación móvil Travel to Europe (EU).

Hacia un nuevo estándar de seguridad

Hasta la fecha, la implementación sigue la lógica de cualquier operativa nueva, con un despliegue gradual que permite ajustes operativos antes de la implementación completa en abril de 2026. Los próximos meses serán determinantes para consolidar un sistema que no solo moderniza la gestión fronteriza europea, sino que también establece un nuevo estándar de seguridad y eficiencia en el control de movimientos transfronterizos.

El EES representa un paso fundamental en la transformación digital de las fronteras europeas, anticipando futuras integraciones con sistemas como ETIAS (Sistema Europeo de Información y Autorización de Viajes), previsto para finales de 2026. 

Esta evolución tecnológica redefine cómo Europa gestiona la movilidad internacional, equilibrando la facilitación del tránsito legítimo con el fortalecimiento de la seguridad común.